روش طبقهبندی احادیث متأثر از نظام طبقهبندی در هر دورهای است که مؤلفان کتب با در نظر گرفتن روشهای مرسوم در عصر خویش به طبقهبندی احادیث میپردازند. کلینی جزء محدثانی است که در طبقهبندی احادیث کتاب شریف «کافی» از روش طبقهبندی عصر خود یعنی طبقهبندی مفهومی آموزههای حدیثی بهره گرفته است. اصل انتخاب و گزینش مفاهیم کلیدی کافی نیز مبتنی بر ضرورتها و مسائل مطرح در زمان تألیف آن است. مهمترین محورهایی که از مقدمه کافی قابل استخراج هستند عبارت است از: عقل و جهل، فضل علم، ضرورت تمسک به سنت و قرآن، توحید، نبوت و امامت، آداب و فرائض و احکام. کلینی با تکیه بر نقش ابزاری عقل، بر تمسک به کتاب و سنت و اخذ معارف از آنها تأکید دارد و کتاب و عقل و جهل و فضل علم را مقدمهای بر مباحث توحید، امامت و اخلاق و احکام قرار داده است. کلینی جامع حدیثی خویش را به شیوه درختی از کل به جزء یا از اصل به فرع تنظیم کرده است.